だが 、 筆頭 株主 が 東邦 電力 と 天竜川 電力 という 電力 会社 で 、 濃く なる 戦雲 の 中 、 天竜川 に 国内 エネルギー 資源 開発 を もくろん で い た 両社 は 、 電源 開発 の 資材 や 労働 力 運搬 の ため 鉄道 を 使用 しよ う として 、 1929 年 8 月 の 天竜峡 駅 - 門 島 駅 間 の 着工 後 も 工事 は 放棄 さ れる こと なく 、 1930 年 に は 南 から 三河 川合 駅 - 出馬 駅 間 も 着工 し た 。

甲斐 武田 氏 は 武田 信玄 後期 に 徳川 領 の 遠江 ・ 三河 へ の 本格 的 侵攻 で ある 西上 作戦 を 実行 し 、 それ まで 同盟 関係 に あっ た 織田 信長 は 徳川 氏 の 同盟 者 で あっ た ため 武田 氏 と 織田 氏 は 手 切 と なり 、 敵対 関係 に 入っ た 。

天正 3 年 （ 1575 年 ） 5 月 に は 三河 の 長篠城 を 巡っ て 武田 勝頼 軍 と 織田 ・ 徳川 連合 軍 と の 間 で 長篠 の 戦い が 発生 し 、 武田 氏 は 主要 家臣 を 多く 失う 大敗 を 喫し 、 武田 家 領国 は 動揺 し た 。

織田 氏 は 畿内 や 北陸 における 一向 宗と の 戦い （ 石山 合戦 ） や 西 の 毛利 氏 と の 戦い に 忙殺 さ れ て い た ため 、 しばらく 軍 を 東 へ 向ける こと は なかっ た ものの 、 信長 の 同盟 者 で ある 三河 の 徳川 家康 は 長篠 の 戦い 以降 武田 氏 に対し 攻勢 を 強め 、 勝頼 は たびたび 出兵 を 余儀なく さ れ た 。

武田 ・ 織田 間 は 友好 的 関係 を 保ち 続け て い た が 、 永 禄 年間 に 武田 氏 は 織田 氏 の 同盟 国 で ある 徳川 家康 の 領国 にあたる 三河 ・ 遠江 方面 へ の 侵攻 を 開始 し 、 元 亀 3 年 （ 1572 年 ） に 信玄 は 信長 と 敵対 し た 将軍 ・ 足利 義昭 の 信長 包囲 網 に 呼応 し て 織田 領 へ の 侵攻 を 開始 し （ 西上 作戦 ） 、 これ により 武田 ・ 織田 間 は 手 切 と なり 、 松 姫 と の 婚約 は 事実 上 解消 さ れ て いる 。

また 、 これ まで は 定期 ・ 臨時 列車 とも 停車駅 は 同じ で あっ た が 、 この 頃 から 下り 臨時 列車 は 浜松 駅 - 豊橋 駅 間 は 各駅 に 停 まっ た 上 で 、 豊橋 駅 - 大垣 駅 間 で 快速 運転 （ 三河 三谷 駅 ・ 共和 駅 ・ 稲沢 駅 に も 停車 ） を する よう に なっ た 。

その後 、 信玄 は 遠江 で 織田 ・ 徳川 連合 軍 を 撃破 し （ 三方 ヶ 原 の 戦い ） 、 三河 に 進ん だ 。

10 月 、 甲斐 国 の 武田 信玄 が 西上 作戦 を 開始 し 、 遠江 ・ 三河 方面 へ 侵攻 し 、 徳川 軍 は 次々 と 城 を 奪わ れ た 。

沿線 に は 、 高校 が 多く 点在 する が 、 県立 高校 普通 科 は 豊田 市 （ 三河 学区 ） と 瀬戸 市 （ 尾張 学区 ） の 市 境 が 学区 の 境界 と なっ て いる ので （ 調整 特例 など は ない ） 、 学区 境界 を 越え て 通学 できる の は 、 開業 時 は 私立 高校 か 全 県 学区 の 公立 高校 の 職業 科 及び 定時 制 課程 だけ で あっ た が 、 2007 年 （ 平成 19 年 ） 4 月 に 豊田 東 高等 学校 、 2008 年 （ 平成 20 年 ） 4 月 に 岡崎 東 高等 学校 、 2009 年 （ 平成 21 年 ） 4 月 に 瀬戸 北 高等 学校 と 、 全 県 学区 の 総合 学科 の 高校 が 次々 設置 さ れ た ため 、 沿線 全域 から 通学 できる 県立 高校 が 増加 する こと に なっ た 。

岳父 で ある 池田 恒 興 と （ 羽黒 の 陣 で 敗北 し た ） 義兄 森長 可 が 三河 に 攻め 入る という 「 中入り 」 策 を 秀吉 に 強く 提案 し 、 信吉 も この 別働隊 の 総 大将 に なり たい と 志願 し て 認め られ た が 、 4 月 9 日 、 白山 林 で 榊原 康政 ・ 大須賀 康 高 ら に 奇襲 さ れ て 、 壊滅 的 な 大敗 を 喫し た の で ある 。

堀 を 埋め た こと と 城郭 の 一部 の 破壊 について は 、 徳川 家康 の 旗本 で あっ た 大久保 彦左衛門 が 著し た 三河 物語 に 詳しい 記述 が ある 。

中世 の 鎌倉 街道 や 、 江戸 時代 の 東海道 宿場 町 、 城下町 として 栄え 、 歴史 的 に 西 三河 地方 の 中心 都市 として 機能 し て き た 。

のち に 大きな 権力 を 有する 豪族 が 現れ 、 4 世紀 後半 に は 比較的 大きな 帆立貝 形 古墳 で ある 於 新造 古墳 が 西阿知和 に 作ら れ 、 4 世紀 末 に は 、 直径 100 メートル 以上 の 、 当時 三河 地方 最大 級 で あっ た 甲山 第 1 号 墳 が 六 供 に 作ら れ た 。

飛鳥 時代 に 入る と 、 6 世紀 に 物部守屋 の 子 ・ 真 福 が 願主 と なり 三河 最古 寺院 真福寺 が 築か れ 、 7 世紀 に は 物部 氏 氏 寺 と さ れる 巨大 古代 寺院 北野 廃寺 が 建立 さ れ た 。

また 927 年 成立 の 延喜 式 で は 、 三河 国三 駅 として 山綱 駅 家 や 宇頭 の 鳥 捕 駅 など が 挙げ られ て いる 。

11 世紀 の 平安 時代 後期 に 藤原 南 家 の 藤原 季 綱 が 三河 守 に なる と 、 兄弟 の 藤原 季 兼 が 岡崎 に 移り住み 、 額田 郡 の 郡司 的 立場 から 荘園 開発 を 進め 、 勢力 を 伸ばし た 。

13 世紀 に 藤原 季 範 の 玄孫 にあたる 足利 氏 宗家 第 3 代 足利 義 氏 が 、 鎌倉 幕府 の 三河 守護 として 、 矢作 東宿 に 拠点 を 構え て 以降 、 足利 氏 や 、 足利 氏 系 氏族 、 足利 氏 家臣 など が 代々 三 河 守護 を 務め た 。

足利 氏 宗家 第 8 代 足利 尊 氏 により 室町 幕府 が 開か れ た 後 は 、 幕府 御料 所 と なっ た が 、 副 将軍 ・ 足利 直義 と 足利 尊氏 執事 の 高師直 の 対立 から 足利 幕府 が 二分 し て 観 応 の 擾乱 が 起きる と 、 三河 の 足利 一族 の 間 で も 争い が なさ れ た 。

特に 15 世紀 の 室町 時代 中期 から 大きな 発展 を 見せ 、 三河 守護 仁木 氏 の 守護 代 だっ た 西郷 氏 が 岡崎 城 を 築城 する とともに 、 矢作川 に 北野 から 矢作 にわたる 堤防 を 作り 、 幾 筋 に も 分流 し て い た 矢作川 を 、 一筋 の 流れ に まとめ た 。

また 、 江戸 中期 に は 矢作川 沿い の 農村 で 綿 作 が 盛ん に 行なわ れる よう に なり 、 三河 木綿 が 特産 品 として 生産 さ れる よう に なっ た 。