本来 の 藤井 システム は 左 美濃 に 対抗 する ため の 研究 で あっ た 。

島 朗 が NHK 杯 で 後手 藤井 システム に ▲ 5 七 角 から 強引 に 高 美濃 に 組み 、 桂 頭 を 狙っ て 勝利 し て いる 。

現在 「 藤井 システム 」 の 主流 の 変化 と なっ て いる もの は 、 居 飛車 穴熊 へ の 新た な 研究 として 現れ た 、 言わば 新 バージョン で ある 。

駒 組み が 特徴 的 な ため 、 真似る の は 容易 で ある と 思わ れ がち だ が 、 指し こなす の は プロ でも 非常 に 難しく 「 藤井 で ない と 藤井 システム は 指せ ない 」 と 言わ れる こと も ある 。

藤井 が 初 披露 し た の は 、 1995 年 12 月 22 日 の 対 ・ 井上 慶太 戦 で あり 、 47 手 の 短 手数 で 井上 を 投了 に 追い込ん だ （ 中 図 は 途中 図 ） 。

1998 年 、 藤井 は この 戦法 を 用い て 谷川 浩司 から 竜王 位 を 奪取 する 。

藤井 システム に対して は 居 飛車 穴熊 に 組む の が 難しい ため 、 色々 な 対抗 策 が 考え られ た 。

しかし 初め から 角 道 の 攻撃 を 避ける ミレニアム 囲い は 、 藤井 システム の 狙い に 少なから ず 影響 を 与え た 。

ミレニアム 囲い は 藤井 システム に対して 新た な 展開 を 見せ た が 、 手数 が かかる 割 に は 穴熊 ほど 堅く なく 、 組み上げる 手間 を 逆用 し て 振り 飛車 側 が 穴熊 に 組む 対応 を 見せ られ 、 藤井 システム に対する 完全 な 対抗 策 に は 至ら なかっ た 。

藤井 システム は 、 居 飛車 側 が 穴熊 囲い で も 急戦 を 仕掛け て き て も 、 どちら に も 対応 できる 戦法 として 猛威 を ふるっ た 。

居 飛車 側 の 対抗 策 として は 、 穴熊 に する か 急戦 を 目指す か の 態度 を ぎりぎり まで 決め ず 、 振り 飛車 （ 藤井 システム ） 側 の 動き によって どちら の 駒 組み に する か を 決める よう に なっ た 。

この ため 駒 組み の 上 で は 藤井 システム の 特徴 で あっ た 「 1 筋 の 突き 越し 」 「 居 玉 」 が なくなり 「 藤井 システム は 消え た 」 と 言わ れる よう に も なっ た 。

藤井 システム に対する 研究 と 改良 が 加わっ た 結果 、 後手 番 で の 藤井 システム は 不利 、 先手 番 で は ほぼ 互角 に 戦える で あろ う 、 と する 結論 に 至っ て いる 。

プロ 間 で は 2004 年 頃 から 、 先手 番 の 藤井 システム に 居 飛車 で 対抗 する 将棋 が 減り 、 代わり に 相 振り 飛車 が 流行 する よう に なっ た 。

藤井 自身 も 模索 を 続け て おり 、 2008 年 に は 矢倉 囲い も 実戦 で 試す よう に なっ た （ ただし 通常 の 矢倉 の 定跡 手順 で は なく 、 相 振り 飛車 も 視野 に 入れ た もの で ある ） ため 、 当時 の 『 週刊 将棋 』 紙 に 「 矢倉 党 に 転向 」 と 紹介 さ れ た こと も あっ た 。

藤井 自身 、 藤井 システム を 「 ファーム 落ち 」 と 表現 し て いる が 、 藤井 システム を 捨て た わけ で は なく 「 い つ 一軍 で 投げ させる か 、 わかり ませ ん よ 」 と し て いる 。

事実 、 藤井 は 2012 年 に 先手 後手 の 双方 で 複数 回 藤井 システム を 指し 、 第 53 期 王位 戦 で は 、 挑戦 者 決定 リーグ で 高橋 道雄 と 牧野 光則 を 、 挑戦 者 決定 戦 で は 渡辺 明 を 破っ て 羽生 王位 へ の 挑戦 権 を 得 た 。

遺 詔 の 「 刻字 之 碑 」 は 、 中世 、 陵 土 の 崩壊 を 見 て 田間 に 落ち て い た の を 発掘 し 、 奈良 春日 社 に 安置 し た の を 、 明和 年間 に 藤井 貞 幹 が 見 て 「 東大寺 要録 」 を 参酌 し て 元明 天皇陵 刻字 之 碑 を 考 定 し た 。

文久 年間 の 修 陵 の 際 に これ を 陵 側 に 移し 、 明治 29 年 藤井 の 「 奈保 山 御陵 考 」 によって 模造 碑 を 作り 、 かたわら に 建て た 。

2006 年 3 月 、 藤井 美英 執行 役 上席 常務 が 規格 争い に 負け たら その 時 は 土下座 する と 発言 。