しかし 、 ヨーロッパ の 諸王 たち は 、 分裂 の 収拾 において 教皇 たち が 話し合っ て 解決 する より は 、 各国 の 枢機卿 団 の 思惑 が 通り やすい 公 会議 の ほう が 自分 たち の 政治 的 意向 を 反映 さ せ うる と 考え 、 公 会議 開催 へ の 世論 と 圧力 を 高め て いっ た 。

シクストゥス 5 世 の 後継 者 として スペイン 系 枢機卿 達 の 後押し で 1590 年 9 月 15 日 に 教皇 に 選出 さ れ た 。

教皇 は 選出 時 に スペイン 枢機卿 団 の 後押し を うけ た 事実 が あっ た ため 、 当然 反 フランス 的 行動 も スペイン より の もの と 考え られ た 。

ファッキネッティ は 法学 で 知ら れ た ボローニャ 大学 を 卒業 し 、 教会 法 の 専門 家 として アルディンゲリ 枢機卿 の 秘書 から ファルネーゼ 家 の 実力 者 アレッサンドロ 枢機卿 の 秘書 と なっ た 。

アレッサンドロ 枢機卿 は パルマ 公 オッターヴィオ・ファルネーゼ の 兄 で 、 先 の 教皇 パウルス 3 世 の 孫 に 当たり 、 アヴィニョン 司教 で あっ た ため 、 ファッキネッティ を 代理 として アヴィニョン に 派遣 し た 。

グレゴリウス 14 世 の 先行き が 短い こと が わかる と 、 スペイン 派 と 反 スペイン 派 の 枢機卿 団 が 活発 な 選挙 工作 を 開始 する 。

前回 の コンクラーヴェ （ 教皇 選挙 ） で は フェリペ 2 世 が 教皇 候補 者 を 7 名 に 限定 する ほど の 高圧 的 な 介入 を 行っ た こと が 、 反 スペイン 派 の 枢機卿 たち の 反感 を 買っ て い た 。

この 時 の 選挙 で は そこ まで の 露骨 な 介入 は 行わ れ なかっ た が 、 依然 スペイン 枢機卿 団 が 大きな 影響 力 を 持っ て い た 。

インノケンティウス 9 世 が 2 ヶ月 の 間 に し た こと は 、 2 人 の 枢機卿 を 任命 し た こと で あっ た 。

親族 の チェーザレ・ファッキネッティ も 1643 年 に 枢機卿 に 上げ られ て いる 。

この よう に 教皇 クレメンス 5 世 の 治世 は 、 当初 から フィリップ 4 世 の 強い 影響 下 に あり 、 クレメンス 5 世 により 多数 の フランス 人 枢機卿 が 任命 さ れ た 。

グエルフィ （ ゲルフ 、 教皇 派 ） の リーダー と 見なさ れ て い た ナポリ 王 の ロベルト 1 世 （ ロベール ） の 秘書 を 務め た のち 、 南仏 プロヴァンス の フレジュス の 司教 、 1310 年 から は アヴィニョン の 司教 を 経 て 1312 年 に 枢機卿 に 任命 さ れ た 。

これ に 先立つ 1303 年 、 アナーニ 事件 の 直後 に 教皇 ボニファティウス 8 世 が ローマ にて 死去 し 、 枢機卿 団 が 分裂 し て 教皇 選挙 （ コンクラーヴェ ） の 実施 に 困難 が 生じ 、 また 、 アナーニ 事件 の 事後 処理 に 絡ん で フランス 王 フィリップ 4 世 （ 端麗 王 ） の 干渉 により 、 1309 年 に 教皇 庁 が 南仏 アヴィニョン に 移る という 事態 が 生じ た （ 「 アヴィニョン 捕 囚 」 ） 。

クレメンス 5 世 が 1314 年 に 死去 し て から は 、 約 2 年間 にわたって 教皇 位 は 空位 で あっ た が 、 1316 年 、 コンクラーヴェ は 新しい 教皇 として 当時 72 歳 頃 で あっ た ドゥーズ 枢機卿 を 選出 し た 。

ドゥーズ 枢機卿 が 新 教皇 ヨハネス 22 世 として 登 位 し た の は 1316 年 8 月 7 日 の こと で あっ た 。

長崎 大司教 区 が 邦人 司教 ヤヌアリオ 早坂 久之助 に なっ た とき 、 当時 の 布教 聖 省 の 枢機卿 は 、 教育 事業 を 目的 と する 日本 女子 修道 会 の 設立 を 強く 勧め た 。

この 時代 は 教皇 選出 において 枢機卿 団 の 思惑 が 錯綜 し 、 世俗 権力 が 介入 し やすい 状況 で あっ た ため 、 特に 神聖 ローマ帝国 など の 君主 によって 教皇 選挙 が 左右 さ れ 、 対立 教皇 が 立て られる など 難しい 時代 で あっ た 。

1076 年 1 月 24 日 に 行わ れ た 会議 に は 教皇 に 反感 を 抱い て い た ドイツ の 高位 聖職 者 だけ で なく 、 かつて の 教皇 の 盟友 で あり ながら 敵対 者 と なっ た 枢機卿 ヒューゴ・カンディデゥス の 姿 も あっ た 。

教皇 の もと に い た 13 人 の 枢機卿 達 は 逃亡 し 、 1084 年 3 月 24 日 、 グイベルト が クレメンス 3 世 として 教皇 位 に つい た 。

彼 は 居並ぶ 枢機卿 たち に こう 言っ た 。