1866 年 、 アレサンデル・コワレフスキー ( Alexander Kovalevsky ) は ホヤ 類 の 幼生 が 尾 部 に もつ 軸 索 状 器官 が 、 脊椎動物 や ナメクジ ウオ の 脊索 と 相 同 で ある こと を 示し た 。

これ によって 、 脊椎動物 、 ナメクジ ウオ を 含む 頭 索 動物 、 および ホヤ を 含む 尾 索 動物 、 が 単 系統 群 で ある こと が 広く 受け入れ られる よう に なっ た 。

その後 は 、 脊椎動物 を 「 脊椎動物 門 」 として 扱い 、 頭 索 動物 と 尾 索 動物 を まとめ て 「 原 索 動物 門 」 ( Protochordata ) として 扱わ れる こと も あっ た 。

しかし 、 尾 索 動物 と 頭 索 動物 と は 「 脊椎動物 に 近い 」 という 便宜 的 な 理由 から 同門 として 扱わ れ て い た 側面 が あり 、 それら の 系統 間 の 類縁 関係 は それほど 近く は なく 、 むしろ 頭 索 動物 と 脊椎動物 と の 間 の 方 が 近い こと が わかっ た ため 、 これら すべて を 脊索 動物 として まとめ て 扱う 分類 が 主流 に なっ て いる 。

一方 で 近年 の 分子 進化 的 な 解析 で は 尾 索 動物 と 脊椎動物 が 姉妹 群 、 頭 索 動物 は それら の 祖先 的 な 系統 関係 と なる こと が 示さ れ て いる 。

石灰 索 動物 は カンブリア 紀 中期 〜 デヴォン 紀中 期 の 海 成層 から 発見 さ れる 化石 生物 で あり 、 棘皮動物 に 非常 に 近 縁 で ある 。

脊索 動物 と 棘皮動物 の 胚 の 体腔 発達 の 類似 性 から 、 脊索 動物 が 棘皮動物 を 起源 と する と 示さ れ て おり 、 石灰 索 動物 は その 化石 証拠 と さ れ て いる もの で ある 。

石灰 索 動物 で ある スティロフォラ の 仲間 は 、 棘皮動物 の よう な 石灰 板 で 覆わ れ た 頭部 と 尾 部 を 持つ 。

尾 部 前端 に は 神経 索 と 脊索 が ある 。

これら の こと から 、 石灰 索 動物 は 、 棘皮動物 と は 異なる もの と さ れ 、 脊索 動物 門 の 一 亜 門 と 考え られ て いる 。

後口 動物 内部 で の 各 グループ の 系統 的 位置 関係 は 様々 に 議論 が あっ た が 、 現在 は 右 図 の よう に 半 索 動物 と 棘皮動物 が 単 系統 で あり 、 脊索 動物 は その 姉妹 群 という こと で 共通 見解 が 得 られ て いる 。

頭 索 動物 と 尾 索 動物 の 位置 、 また 円 口 類 の 単 系統 性 など 、 分子 系統 によって 明らか に さ れ た 部分 も 多い 。

『 史記 索 隠 』 で は 、 その 祖先 は 韓 の 公 族 で あり 、 周 王室 と 同じ 姫 姓 で あっ た が 、 秦 による 賊 探索 から 逃れる ため に 張 氏 に 改名 し た こと に なっ て いる 。

尾 索 動物 （ びさくどうぶつ 、 Urochordata または Tunicata ） と は 、 動物 界 脊索 動物 門 の 下位 分類 群 の ひとつ で 、 ホヤ 類 、 タリア 類 、 オタマボヤ 類 の 3 つ の 動物 の グループ の 総称 。

3 つ の グループ 、 ホヤ 類 、 オタマボヤ 類 、 タリア 類 で は 、 その 特徴 は 大きく 異なる が 、 共通 する の は 、 幼生 の 時期 に オタマジャクシ の 形 を し て おり 、 プランクトン 生活 を する こと 、 その 時期 に は 、 内臓 など は 頭部 に 、 長い 尾 の 部分 に 脊索 や 、 背 側 神経 索 、 筋肉 が 存在 する こと で ある 。

脊索 が 尾 部 に 存在 する こと が 、 尾 索 動物 の 名 の 由来 で ある 。

いずれ の グループ も 、 脊椎動物 と は 異なり 、 背 側 神経 索 を 中心 と し た 中枢 神経 系 は 発達 せ ず 、 脳 を 持た ない 。

ホヤ の 幼生 は 海底 に たどり着き 、 頭部 を 下 に し て 付着 する と 、 尾 部 は 吸収 さ れ 、 同時に 脊索 や 背 側 神経 索 も 消滅 する 。

この 被 嚢 が 、 尾 索 動物 の 別名 、 被 嚢 動物 の 名前 の 由来 で ある 。

脊索 、 神経 索 の 存在 など 、 脊椎動物 と 比較的 形態 が 似 て い て 、 尾 部 の 運動 により 移動 できる の が 幼生 の 時期 だけ で ある こと から 、 脊椎動物 は 、 尾 索 動物 の 幼生 の 形態 に 近い もの から 進化 し た 、 一種 の 幼 形成 熟 で ある と 主張 する 人 も いる （ Tokioka , T . 1971 など ） 。