その後 MF ビタウ 、 元 大分 の FW アンドラジーニャ 、 元 名古屋 の MF ウリダ を 獲得 し た が 、 8 月 2 日 の 新潟 戦 で 大敗 を 喫し ジョアン・カルロス が 辞任 。

川崎 から フッキ 、 千葉 から 芳賀 博信 、 山形 から 大塚 真司 と 川崎 健太郎 、 水戸 から 関 隆 倫 、 アルビレックス 新潟 シンガポール から 野本 安啓 、 名古屋 から セバスティアン を 獲得 し 、 ユース から 藤田 征 也 と 西 大伍 が 昇格 し た 。

天皇 杯 で は J 1 の 千葉 、 新潟 、 甲府 を 破り 初 の ベスト 4 に 進出 。

広島 から 吉 弘充 志 を 完全 移籍 で 、 神戸 の 坪内 秀 介 、 清水 の 平岡 康裕 、 新潟 の MF ディビッドソン 純 マーカス を レンタル 移籍 で 獲得 、 新人 は 室蘭 大谷 高校 の 宮澤 裕樹 と 柏 U - 18 の 堀田 秀平 が 入団 し た 。

西 大伍 が 新潟 へ 、 ダニ ルソン が 名古屋 へ レンタル 移籍 、 曽田 雄志 が 現役 を 引退 し た 一方 、 6 チーム と の 競合 を 制し て 磐田 から 中山 雅史 を 獲得 。

6 年 半 在籍 し た 西嶋 弘之 が 徳島 へ 、 ユース 時代 から 在籍 し て い た 藤田 征 也 と キャプテン を 務め た 石川 直樹 が 新潟 へ 、 佐藤 優 也 が 北九州 へ 、 吉 弘充 志 が 愛媛 へ 、 堀田 秀平 が 新潟 シンガポール へ 、 李 漢 宰 が 岐阜 へ 、 新潟 に レンタル 移籍 し て い た 西 大伍 が 鹿島 へ 完全 移籍 し た 。

一方 、 新潟 から 高木 貴弘 、 C 大阪 から 山下 達也 、 鳥栖 から 日高 拓磨 、 横浜 FM から 河合 竜二 を 獲得 、 レンタル 移籍 だっ た 高木 純 平 は 完全 移籍 と なり 、 三上 陽 輔 が ユース から 昇格 し 、 室蘭 大谷 高校 の 櫛引 一紀 が 入団 し た 。

一方 で 、 鹿島 から 杉山 哲 、 広島 から 髙柳 一誠 、 大分 から 前田 俊介 、 清水 から 山本 真希 、 新潟 から 大島 秀夫 、 FC 東京 から オーストラリア 代表 の ジェイド・ノース を 完全 移籍 で 、 ジュニーニョ を レンタル 移籍 で 獲得 。

また 、 鹿島 から DF 相馬 直樹 、 新潟 から 2 年 連続 で J 2 リーグ 得点 王 の マルクス を 補強 し た 。

開幕 戦 の 新潟 戦 で 我那覇 和樹 の ハットトリック など により 6 - 0 、 第 2 節 の 京都 戦 で も ジュニーニョ の ハットトリック を 含む 7 - 2 で 下し 、 開幕 2 試合 で 13 得点 の J リーグ 新 記録 を 打ち立て て 好 スタート を 切り 、 2006 FIFA ワールドカップ 前 の 中断 期間 を 暫定 ながら 首位 で 折り返し た 。

しかし 、 中盤 戦 （ 夏場 の 連戦 ） 以降 失速 し 、 7 月 23 日 （ 第 6 節 ） の 新潟 戦 から 9 月 11 日 （ 第 25 節 ） の 神戸 戦 まで リーグ 8 連敗 を 喫し た 。

特に J 2 時代 も 含め て 新潟 と の 東北電力 ビッグスワンスタジアム において 行わ れ た 試合 において 勝利 が なく ( 2012 年 に 初めて 勝利 し た )、 新潟 戦 を 対象 と し た アウェイゲーム で は 大々的 な 企画 を 実施 し て いる 。

退団 が 相次い だ センター バック に は 大分 から 森 重 真人 、 全 州 大 学校 から キム ・ ヨングン を 、 また 、 新潟 から MF 松下 年 宏 を 、 ブラジル の ABC FC から FW リカルジーニョ を 期限 付き 移籍 で 獲得 する も 、 登録 選手 は J 1 最少 の 26 人 、 選手 の 平均 年齢 は J 1 で 2 番目 の 若 さ という 陣容 だっ た 。

また 、 財前 宣之 ら 7 選手 が 退団 し 、 ゲーム メーカー の シルビーニョ も 新潟 へ 移籍 し た 。

第 3 クール に 入っ て 失点 が 増え た こと など から 、 7 月 に 元 新潟 の MF ファビーニョ を 、 続く 8 月 に は 柏 から DF 岡山 一成 を いずれ も 期限 付き 移籍 で 獲得 。

草津 （ 途中 C 大阪 に レンタル 移籍 ） から MF ヘベルチ 、 東京 V から DF 和田 拓也 、 新潟 から DF 石川 直樹 、 G 大阪 から MF 佐々木 勇人 を 完全 移籍 で 、 スポルチ・レシフェ から MF ジオゴ を レンタル 移籍 で 獲得 。

新潟 元 監督 の 永井 良和 が 後任 監督 に 就任 し た が 、 シーズン 途中 に 退任 し 、 9 月 に 信 藤 健仁 が 監督 に 就任 し た 。

シーズン 前 に 新潟 から 木 澤 正徳 、 川崎 から 池田 伸 康 など ベテラン 勢 を 獲得 する も 、 シーズン 前半 は 1 勝 しか 挙げ られ なかっ た 。

遠藤 敬 佑 、 保崎 淳 が 草津 へ 、 小池 純 輝 が 東京 V へ 、 神村 奨 が 新潟 シンガポール へ 、 常盤 聡 が 北九州 へ 完全 移籍 、 鶴野 太 貴 ら 4 人 が 退団 、 補強 は 、 甲府 から 元 日本 代表 の 市川 大 祐 、 神戸 から 三島 康平 、 徳島 から 輪 湖 直樹 、 名古屋 から 橋本 晃司 を 完全 移籍 で 獲得 、 キム ・ ヨンギ 、 石神 幸 征 、 内田 航 平 、 鈴木 雄 斗 が 新 加入 し た 。

補強 面 で は 冨田 大介 が 10 年 ぶり に 復帰 、 横浜 FC から 難波 宏明 、 新潟 から 木暮 郁 哉 を レンタル で 、 神戸 から 近藤 岳 登 を 完全 移籍 で 獲得 。