2004 年 に は 、 皇居 に 招か れ 今上 天皇 ・ 皇后 と 紀宮 清子 内親王 へ アフガニスタン の 現況 報告 を 行っ た 。
さらに 今上 天皇 が 登場 し 、 ホーマー の 勝利 を 英語 で 祝福 する が 、 ホーマー は 天皇 も 投げ飛ばし て しまっ た ため 、 日本人 たち から は 罵声 と 物 が 投げつけ られ 、 ホーマー と バート は 逮捕 さ れる 。
日本 と の 関係 で は 、 1990 年 ( 平成 2 年 ) 11 月 12 日 に 行わ れ た 今上 天皇 の 即位 の 礼 に 参列 する ため に 夫人 を 伴い 訪日 し て いる 。
大学 で は 今上 天皇 と 同 学年 と なる 。
日本 の 皇室 と スペイン 王室 と の 間 に は 緊密 な 交流 が あり 、 日本 の 今上 天皇 は 4 回 、 徳 仁 親王 は 5 回 訪西 し 、 また スペイン の 国王 フアン・カルロス 1 世 ・ ソフィア 王妃 夫妻 は 7 回 、 国王 フェリペ 6 世 は 王 太子 時代 に 3 回 訪日 し て いる 。
2012 年 2 月 18 日 に 、 今上 天皇 の 狭心症 冠動脈 バイパス 手術 を 執刀 。
上記 の うち 、 立 柱 祭 ・ 上棟 祭 ・ 杵築 祭 ・ 後 鎮祭 ・ 遷御 ・ 奉幣 は 、 今上 天皇 による 御 治定 ( ご じじ ょう 、 日程 の 御 定め ) に 基づく 。
この 式 の 際 に は 、 日本 から 皇太子 明仁 親王 ( 今上 天皇 ) が 、 昭和 天皇 の 名代 として 列席 し た 。
今上 天皇 の 「 ご 学友 」 という こと で 、 様々 な メディア から 皇室 の 諸 問題 に関する 意見 を 求め られる こと が 多い 。
学習 院 高等 科 在学 中 、 同級生 だっ た 当時 皇太子 の 今上 天皇 から 銀座 に 行き たい と 相談 さ れ 、 「 今宵 、 殿下 を 目白 の 方 に ご 案内 し たい 。 」 と 皇太子 側近 を 騙し 、 同級生 で 出雲 国造 家 出身 の 千家 崇 彦 と 3 人 で 銀座 に 繰り出し 大騒ぎ と なる ( いわゆる 「 銀 ブラ 事件 」 ) 。
今上 天皇 ご 学友 という 立場 から 、 テレビ 番組 ・ ワイドショー ・ 週刊 誌 等 に たびたび 出演 し 、 皇室 典範 改正 問題 について 女系 天皇 容認 の 立場 で 論陣 を 張っ て いる 。
以下 同じ ) する 場合 は 、 原本 に は 所定 の 位置 に 天皇 の 名 ( 御名 ) が 毛筆 で ( 今上 天皇 の 例 で は 「 明仁 」 と ) 書か れる が 、 それ が 官報 に 公布 ( 掲載 ) さ れる 際 に は ( 「 貴人 の 諱 を 禁忌 と する 」 慣例 から ) そのまま 「 明仁 」 と は 活字 印刷 さ れ ず 「 御名 」 という 2 文字 に 置き換え られる 。
現在 の 日本 の 天皇 の 即位 の 礼 が 先代 天皇 の 数え年 で 崩御 後 3 年 目 に 行わ れる の も 、 この 「 諒闇 」 の 観念 によって いる ( ただし 今上 天皇 の 即位 の 礼 は 昭和 天皇 崩御 の 翌年 に 行わ れ た ) 。
1959 年 の 皇太子 ( 現 ・ 今上 天皇 ) の 御 成婚 奉祝 の 花電車 が 運行 さ れ た の が 最後 で 、 1968 年 まで に 全車 が 廃車 さ れ た 。
また 昭和 天皇 大喪 の 礼 、 今上 天皇 即位 の 礼 の 際 に も 自衛隊 による 21 発 の 皇 礼砲 が 撃た れ た 。
1997 年 に 日本 の 今上 天皇 が ブラジル を 訪問 し た 際 、 日系 ブラジル 人 が 多く 在住 する パラナ 州 クリティーバ 市 も 訪問 する こと と なっ た が 、 当 空港 の 滑走 路 は メイン 滑走 路 で も 2 , 200 メートル と 比較的 短く 、 これ は 日本国 政府 専用 機 の ベース 機 で ある ボーイング 747 の 運用 にあたって 通常 求め られる 2 , 500 メートル を 満たし て おら ず 、 天皇 来訪 に際して は 、 着陸 後 ・ 離陸 前 の 機動 において 狭い 空港 内 で 脱 輪 など の 支障 が 起きる こと も 含め 、 空港 設備 について 懸念 が 持た れ て い た 。
初演 時 に は 、 今上 天皇 ・ 皇后 が 臨席 し て 鑑賞 し た ( 天覧 公演 ) 。
当時 浪人 生 で あっ た 作者 が 2001 年 の 今上 天皇 の 発言 ( 桓武 天皇 の 生母 高 野新 笠 が 百 済 の 武 寧 王 の 子孫 で あっ た と さ れ て いる こと に関する もの ) に 触発 さ れ 、 「 50 冊 もの 」 資料 を 読ん で 書き上げ た ( 参考 文献 一覧 が ない ため 、 どの よう な 資料 を 読ん だ の か は 不明 ) という 作品 。
今上 天皇 ・ 皇后 も 祭祀 に は きわめて 熱心 で あり 、 諒闇 ( 服喪 中 ) や 病気 を 除く と ほとんど の 宮中 祭祀 に 代 拝 を 立て ず 御 自ら 出席 し て いる 。
今上 天皇 も 新嘗祭 の 時節 が 近づく と 、 昭和 天皇 と 同様 に 正座 の 練習 を する と の こと で ある 。