医科 大学 ・ 歯科 大学 附属 病院 で は 、 各 診療 科 の 医師 ・ 歯科 医師 の 人事 について は 大学 病院 で は なく 各 医局 の 長 で ある 教授 が 実質 的 人事 権 を 持つ こと が 多い 。

なお 、 附属 病院 における 医局 と 学部 における 講座 は 実質 的 に 同一 で ある （ 医局 講座 制 ） こと を 考えれ ば 、 各 講座 の 医師 ・ 歯科 医師 の 人事 について は 大学 で は なく 各 講座 の 長 で ある 教授 が 実質 的 人事 権 を 持つ こと が 多い と 読み替える こと が できる 。

上記 人事 は 病院 内 で の 職場 配置 だけ で なく 、 関連 病院 へ の 派遣 も 含ま れる 。

すなわち 関連 病院 は 診療 科 ごと に 医師 ・ 歯科 医師 の 人材 の 供給 を 大学 に 依存 し て いる 。

公立 病院 で あっ て も 例外 で は なく 、 この こと を 問題 視 する 声 も ある 。

特に 自治体 の 設置 する 病院 など 公的 な 性質 の 強い 病院 の 場合 は 、 医師 を 含め 職員 の 採用 は 本来 求人 を 公 に 行い 、 学歴 に 関係 なく 実績 や 能力 の ある もの が 採用 さ れる べき で ある 。

ところが 医局 による 人事 で は 、 全て が 病院 と 直接 関係 ない 地元 の 医学部 教授 に 一任 さ れ 、 時には 採用 さ れる 医師 の 意向 さえ 無視 し 教授 の 独断 で 就職 さ せ られる こと も あり 、 問題 と なっ て き た 。

従って 、 経験 が 浅く 、 賃金 も 安い 医師 を 雇用 し た 方 が 病院 として は 経営 上 有利 で ある 。

医局 は この よう な 病院 側 の 事情 を くみ 入れ 、 必要 に 応じ て 医師 を 転属 さ せる 。

こうして 病院 は 人件 費 を 一定 に 抑え 、 経営 を 安定 さ せよ う と 図る 。

医師 の 派遣 を 受け た 関連 病院 は 研究 費 を 提供 する など し て 教授 の 研究 業績 に 寄与 し 、 有名 教授 の 下 に は さらに 入局 者 が 集まる という 図式 で あっ た 。

派遣 さ れる 医師 は 、 病院 を 点々 と 転属 し ながら 経験 を 積ん で 、 理想 的 に は 自分 の 技量 レベル を 最も 求め て いる 病院 へ と 赴く 。

しかし 、 現実 に は すべて の 病院 が 理想 的 な 職場 環境 で は なく 、 医局 人事 は （ 理想 的 に は ） 低 待遇 の 病院 を 出来る だけ 多く の 医師 の 間 に 割り振っ て 、 特定 の 医師 が 低 待遇 の 病院 で 長期 搾取 さ れる こと を 防止 する 役目 も ある 。

教授 を 頂点 と する 医局 の システム は 診療 科 の 診療 方針 全般 及び 上記 の よう に 関連 病院 の 人事 について 決定 権 を 持つ ため 、 治療 薬 の 選択 、 医療 機器 の 導入 、 各 医学部 による 関連 病院 の 実質 的 な 支配 など 大きな 利権 が 生じる 余地 が ある こと 、 医局 ごと に 独立 性 が 強い 一方 で 他 の 医局 と の 連携 が 悪かっ た ため に 「 隣 の 医局 は 外国 より も 遠い 」 と 表現 さ れ て おり 、 長年 批判 の 対象 と なっ て き た 。

以前 なら ば 大学 の 医局 に 入局 し た 卒 後 医師 の 多く が 、 都市 部 の 大 病院 で の 研修 を 希望 し た 結果 、 医局 に 入局 する 医師 の 数 は 激減 し て いる 。

その 結果 、 大学 病院 自体 の 人手 が 不足 し 、 さらに 地方 の 関連 病院 や 過疎 地 の 診療 施設 へ 赴任 する 医師 が 激減 し て いる 。

一連 の 厚生 労働省 の 施策 は 、 いま まで の 悪しき 習慣 として の 医局 を 破壊 し 、 権力 を 削ぐ という 点 で は 一定 の 成果 を 挙げ た ものの 、 地方 の 基幹 病院 の 統廃合 と レベルアップ の 方策 が ない まま に 、 医局 による 医師 派遣 を 必要 と し て き た 地域 医療 の 崩壊 を もたらし て いる として 、 功罪 半ば と 言える 。

元々 、 伝統 的 な 医局 制度 を 設け て い なかっ た の は 、 筑波大学 附属 病院 で ある 。

弘前大学 医学部 の よう に 不祥事 の 多発 が 看過 さ れ 続け て き た ため 公 に 「 医局 を 廃止 する 」 と 宣言 する 大学 が 現れる 一方 、 医局 の Web を 掲載 し て 大学 病院 における 情報 公開 と 連動 し て 医局 員 の 募集 を 行っ て いる 医局 も 多い 。

大学 病院 の 医師 に かかわら ず 一般 の 医師 で も 、 大学 病院 の 医局 の 存在 自体 を 積極 的 あるいは 消極 的 に 肯定 する 者 も 多い 。